Miksi klusterissa on niin vähän systeemejä? Miksi yhteys muihin klustereihin on poikki? Katkaisiko joku ne joskus jostain syystä? Voisiko ne palauttaa?
Mitä alienit ovat ja mitä ne haluavat?
Ovatko tietokoneet ja tuunaajat sitä miltä ne näyttävät?
Mikä on alien-viruksen tausta ja tarkoitus?
Mihin aiemmat T4-sivilisaatiot ovat kadonneet? Onko niiden raunioita jossain ja löytyisikö niistä vihjeitä erinäisiin kysymyksiin?
Onko olemassa jotain muita salaisia ja voimakkaita faktioita? Onko olemassa joku mastermind jossain joka manipuloi asioita?